A estrutura organizacional da AFRINIC facilita um modelo de autogovernança de baixo para cima, onde as políticas e outras funções organizacionais são determinadas por Membros da AFRINIC e a Comunidade AFRINIC.
A organização é supervisionada pelo Conselho de Administração, eleito pelos membros da AFRINIC. O Conselho é composto por representantes de cada uma das seis sub-regiões da África e dois diretores adicionais eleitos em uma base não regional. O Conselho é apoiado pelo Conselho de Anciãos, que desempenha um papel consultivo (ver Artigo 16 no Estatuto AFRÍNICO).
As operações diárias da AFRINIC estão sob a responsabilidade do CEO (Chief Executive Officer) para.
